Home / SCIENCE

Selasa, 6 September 2022 - 05:23 WIB

Lanskap sel lintas spesies dibangun pada tingkat sel tunggal


Penelitian Asam Nukleat (2022). DOI: 10.1093/nar/gkac633″ width=”743″ height=”530″/>

Kredit: Penelitian Asam Nukleat (2022). DOI: 10.1093/nar/gkac633

Berkat sekuensing RNA sel tunggal throughput tinggi (scRNA-seq), dimungkinkan untuk membangun atlas transkriptomik sel tunggal pada tingkat organik. Sebagai contoh, atlas sel untuk sistem vertebrata dan invertebrata telah berhasil dibuat, seperti Human Cell Landscape (HSC), Mouse Cell Atlas (MCA), Zebrafish Cell Landscape (ZCL) dan embrio Drosophila. Namun, sebagian besar studi ini terbatas pada satu spesies atau periode tertentu dan dengan demikian gagal membuat perbandingan menyeluruh antara spesies dan jaringan yang berbeda.

Tim peneliti yang dipimpin oleh Assoc. Prof. Han Xiaoping dan Prof. Guo Guoji di Fakultas Kedokteran Universitas Zhejiang menggunakan teknologi Microwell-seq untuk membuat profil lebih dari 2,6 juta sel tunggal dari tikus, ikan zebra, dan Drosophila pada tahap kehidupan yang berbeda. Berdasarkan kekuatan kumpulan data komprehensif ini, mereka membangun lanskap sel lintas spesies dan menyelidiki jalur umum yang berubah sepanjang masa hidup mereka. Temuan mereka dipublikasikan di jurnal Penelitian Asam Nukleat.

Han & Guo dkk. mengidentifikasi kecenderungan jenis sel dan gen yang berubah seiring perkembangan dan usia pada tikus, ikan zebra, dan Drosophila, dan menemukan bahwa proporsi sel kekebalan secara bertahap meningkat seiring bertambahnya usia pada ketiga spesies tersebut. Pada tikus, proporsi sel T menurun seiring bertambahnya usia sedangkan sel B meningkat; respon inflamasi jaringan juga meningkat seiring bertambahnya usia.

Lintasan ekspresi gen menunjukkan tren serupa di ketiga spesies sepanjang siklus hidup mereka: respons imun diaktifkan sementara jalur terkait metabolisme mitokondria diatur ke bawah. Selain itu, analisis regulasi faktor transkripsi mengungkapkan bahwa beberapa garis keturunan sel diatur oleh keluarga gen serupa di seluruh spesies.

Analisis lintas spesies pada tikus, tikus, ikan zebra, Drosophila dan Nematostella menunjukkan bahwa respons imun dan fungsi mitokondria adalah dua jalur pensinyalan penting dalam proses penuaan. Dengan mengukur aktivitas faktor transkripsi dan korelasi antara gen yang diatur ke atas dan ke bawah, Han & Guo et al. mengidentifikasi beberapa faktor transkripsi yang mungkin terlibat dalam kekebalan, metabolisme lipid dan metabolisme energi dan memainkan peran pengaturan dalam proses penuaan pada beberapa spesies.

Dengan merawat tikus berusia dua tahun dengan obat pioglitazone (PGZ) yang disetujui FDA, mereka menemukan bahwa fenotipe penuaan berkurang. Ini mengungkapkan bahwa metabolisme mitokondria dan peradangan selama penuaan mungkin saling berhubungan melalui jaringan regulasi intrinsik, dan pengobatan PGZ dapat secara efektif memodulasi status oksidatif dan inflamasi, penuaan sel dan metabolisme lipid.

Studi ini diharapkan dapat memberikan sumber daya yang berharga untuk penelitian tentang pengembangan garis keturunan, pematangan dan penuaan.


Para ilmuwan mengidentifikasi program pengaturan nasib sel menggunakan atlas sel tunggal perkembangan tikus


Informasi lebih lanjut:
Renying Wang et al, Konstruksi lanskap sel lintas spesies pada tingkat sel tunggal, Penelitian Asam Nukleat (2022). DOI: 10.1093/nar/gkac633

Disediakan oleh Universitas Zhejiang

Kutipan: Lanskap sel lintas spesies yang dibangun pada tingkat sel tunggal (2022, 5 September) diambil 5 September 2022 dari https://phys.org/news/2022-09-cross-species-cell-landscape-single-cell.html

Dokumen ini tunduk pada hak cipta. Terlepas dari transaksi wajar apa pun untuk tujuan studi atau penelitian pribadi, tidak ada bagian yang boleh direproduksi tanpa izin tertulis. Konten disediakan untuk tujuan informasi saja.





Source link

Share :

Baca Juga

Bagaimana hawkmoth kepala maut berhasil terbang lurus dalam kegelapan

SCIENCE

Bagaimana hawkmoth kepala maut berhasil terbang lurus dalam kegelapan
Kenya: Bagaimana kebutuhan gajah yatim piatu akan susu memberdayakan para wanita Samburu

SCIENCE

Kenya: Bagaimana kebutuhan gajah yatim piatu akan susu memberdayakan para wanita Samburu

SCIENCE

Alam semesta jarum jam: apakah kehendak bebas adalah ilusi? – podcast | Berita

SCIENCE

Terrawatch: Lihat seperti apa bentuk gunung berapi perisai lava | ل gunung berapi

SCIENCE

Cara mengambil foto gerhana bulan dan bulan super berdarah yang bagus untuk bulan Mei dengan ponsel atau kamera | bulan
pictures of bananas arranged in a row from brown to yellow to green

SCIENCE

Semua orang menggambar angka di luar angkasa. Tapi mengapa kita tidak menggunakan arah yang sama?

SCIENCE

Ada kabar baik dalam pertempuran melawan Covid panjang | Danny Altmann

SCIENCE

Bisakah Anda menyelesaikannya? Kehebatan Hamilton di internet | matematika